Parallel zur Urzeit-Ausstellung präsentiert das Natur-Museum im Treppenhaus ausgewählte Fossilien aus der geologischen Sammlung, darunter Ammoniten, Seeigel, Muscheln, Fische, Pflanzen und sogar einen Ichthyosaurier! Wie die Sammlung, so weist auch die Ausstellung einen regionalen Schwerpunkt auf. Viele Objekte stammen aus der Stadt Luzern oder ihrer Umgebung, bilden also ab, was genau an diesem Ort lange vor uns gelebt hat. Neben der Naturgeschichte hat jedes Objekt auch die Geschichte seines Weges in die Sammlung zu erzählen. Franz Joseph Kaufmann zum Beispiel, Sammlungskonservator des damaligen Naturhistorischen Museums Luzern, hat im 19. Jahrhundert als Erster die regionale Geologie untersucht und dabei viele spannende Fossilien entdeckt.