Ein aufkommender Sturm bringt eine Gruppe Wissenschaftler der Forschungsplattform AQUATICA in der Baja California in tödliche Gefahr.

Dr. Susan McAlester (Saffron Burrows) hat dort jahrelang genetische Experimente an Mako-Haien durchgeführt und dabei ethische Barrieren überschritten. Ein Unfall während d~r Hirngewebeentnahme macht in der Folge aus den Haien riesige, intelligente Killer.

Andere Wissenschafter auf der Platfform, insbesondere der Hai Experte Carter Blake (Thomas Jane), aber auch einer der Geldgeber Russel Franklin (Samuel L. Jackson) versuchen die Experimente zu stoppen. Leider zu spät.

Auf der langsam sinkenden AQUATICA kommt es zum Kampf gegen den Sturm und die von der Wissenschaft erzeugten Killern - dabei wird der Mensch zur bedrohten Art.