Das St.-Johanns-Tor ist ein ehemaliges Stadttor der Stadt Basel und früherer Bestandteil der Basler Stadtmauer. Es ist eines der drei Stadttore, welche heute noch existieren, und steht unter Denkmalschutz.

Einer der wenigen überlebenden Zeugen der Stadtmauer aus dem 14.Jh ist das St.Johanns-Tor. Man vermutete ein früheres Tor an dieser Stelle, und wirklich traten bei Grabungsarbeiten im Jahr 1984 unter dem stadtseitigen Vorplatz, beim Zollerhäuschen alte Fundamentmauern zutage. Aber eine Darstellung von Matthäus Merian zeigt, dass es sich nicht um ein Tor sondern um einen hallenartigen Anbau mit einem Giebeldach und Rundbogeneingang handelte.

Nähere Untersuchungen am eigentlichen Tor ergaben, dass es zwischen 1367 und 1375 erbaut wurde. Es wird in der Wachtordnung von 1374 (1.) namentlich genannt. Die Fenster auf jedem Stockwerk an der Stadtseite des Turmes wurden vermutlich erst während der Umbauarbeiten an der Stadtmauer zwischen 1431 und 1448 ausgebrochen. Im Jahr 1482 liess die Stadt das Tor durch Malereien schmücken.