Ausgrabungsfunde von Jakob Messikommer bilden den Grundstein der ursprünglichen Sammlung des Museums Wetzikon. Heute umfasst die Sammlung folgende Schwerpunkte: Jungsteinzeit, Pfahlbauer und Römer, Alltagsgegenstände aus den letzten zwei Jahrhunderten, Textilien und Schulbücher. Ebenso werden Objekte von Persönlichkeiten wie Jakob Messikommer, Hans Georg Nägeli oder Jakob Stutz ausgestellt. Dank Wechselausstellungen, regelmässigen Veranstaltungen für die Öffentlichkeit und der praktischen Arbeit mit Schulklassen hat das Museum einen festen Platz im kulturellen Leben von Wetzikon.